庆应义塾大学医学部学费是最高的，初年度缴纳费用总额为384.3350万日元（约合人民币24.59万元）；其次是药学部药学科的245.3350万日元（约合人民币15.70万元）和药科学科的218.3350万日元（约合人民币13.97万元）。
与修士课程相比，整体来看，相应的博士课程学费又有所降低！学费最高的是メディアデザイン研究科和システムデザイン? マネジメント研究科的120.2600万日元（约合人民币7.69万元），其次是医学研究科的117.2600万日元（约合人民币7.50万元）。
庆应义塾大学申请材料
申请学部的学生需准备以下材料：
出愿确认票；入学检定料收取证明书；入学志愿票；入学志愿者调书；高中毕业证明书；高中毕业证；高中成绩单；英语能力证明书；推荐信；住民票或者护照复印件；日本留学考试成绩通知书复印件；TOEFL iBT或者IELTS成绩结果；志望理由书；小论文；日本语能力测试N1结果。
申请大学院的学生需准备以下材料：
出愿确认票；入学志愿票；入学愿书；照片；入学检定料收取证明书；护照复印件；最终出身校毕业证明；最终出身校成绩单；志愿者相关报告书；日本语能力考试N1成绩认定结果证明。
庆应义塾大学专业设置
本科生学部：文学部，经济学部、法学部（法律学科，政治学科）、商学部、医学部、理工学部、综合政策学部、环境信息学部、护理医疗部、药学部。另外还有日本大学中规模最大的函授部。
研究生院设有文学研究科、经济学研究科、法学研究科（法律，政治）、社会学研究科、商学研究科、医学研究科、理工学研究科、政策传媒研究科、经营管理研究科、健康管理研究科、药学研究科、系统设计管理研究科、媒体设计研究科、法务研究科（法科大学院）等14个研究科。
研究所有：语言教育研究所、新闻研究所、经济研究所、斯道文库（东亚文化研究所）、体育教育研究所、计算机教育研究所等，此外还有语言视听教育中心、电脑中心、师资培训中心、福泽谕吉研究中心（现代日本研究中心）、体育医学研究中心、电子显微镜研究室和地域研究中心等全校共同使用的研究设施。
