1870年新潟的共立医院设立，即现在的新潟大学的最初样态。新潟大学前身--新潟医学专门学校
1874年官立（国立）新潟师范学校设立。
1910年官立（国立）新潟医学专门学校开校，后发展为新潟医科大学（现新潟大学母体）。
1919年新潟高等学校设立。
1922年新潟县立农业补习学校教员培养机构设立。
1923年长冈高等工业学校设立（现新潟大学工学部）。
1945年新潟县立农林专门学校成立（现新潟大学农学部）。
1949年二战之后，根据日本国“国立大学设置法”，将当时的新潟医科1930年代在新潟医大召开的日本生理学大会大学·旧制新潟高等学校·新潟第一师范学校·新潟第二师范学校·新潟青年师范学校·县立农林专门学校·长冈工业专门学校合并，成立了新制的国立综合性大学“新潟大学”。当时设置了人文学部、教育学部、理学部、医学部、工学部、农学部6个学部。
1955年设立大学院医学研究科博士课程。
1965年设立齿学部。1968年以后，医学部·齿学部以外的全学部搬迁至五十岚地区。战后改革重组的新潟大学开学
1977年人文学部改组为法文学部、后又改组为人文学部、法学部、经济学部等3学部，教育学部改组为教育人类科学部。
2004年根据国立大学法人法，改为国立大学法人新潟大学。并将大学院人文科学科、法学研究科、经济学研究科三科改组为“现代社会文化研究科（博士前期课程）”。
2006年设立了大学院技术经营研究科（专门职业课程）。
2007年设立了大学院保健学研究科（博士课程）。
2008年大学院重点化。将教育人间科学部改组为教育学部。
