神学研究科
培育为社会与基督教界作贡献的神学专业人才。硕士课程设有基督教神学·传道者课程与基督教思想·文化课程。前者培育作为基督教界领导所应具备的实践能力，后者进一步深化研究基督教思想文化领域的专业知识。博士课程则提高继续进行高度神学研究所需要的学术性能力。
神学专攻
基督教神学、传道者课程
基督教思想、文化课程
文学研究科
文学研究科由文化历史学专业、综合心理科学专业、文学言语学专业三项专业构成，前期课程划分为12个领域，后期课程划分为11个领域。其特点是学习环境优越，既有丰富的资(史)料资源，又有齐全的调查研究设备。同时，还邀请各界专家来校讲课，并进行细致严谨的论文指导。
文化历史专攻
哲学伦理学、美学艺术学、地理学地域文化学、日本史学、亚洲史学、西洋史学
综合心理科专攻
心理科学
文学言语专攻
日本文学日本语学、英美文学英语学、法国文学法语学、德国文学德语学
社会学研究科
以“社会调查”和“socio-literacy”为关键概念。培养将专门研究应用于解决现实课题的能力。硕士课程设有培养社会调查专家的“专门社会调查士课程”。博士课程则与“先端社会研究所”携手合作，培养领先世界的年轻学者。
社会学专攻
法学研究科
硕士课程在“法学·政治学”专业中，设有“学术专题”和“专家专题”两门课程。“专家专题”又分为“法律实务”、“商业法务”、“公共政策”、“国际关系”、“自由研究”五个单项课题。博士课程由“政治学”、“基础法学”、“民事·刑事法学”三专业构成。重视深入观察社会现实，培养高度的研究能力与专业性。
法学、政治学专攻（硕士）
政治学专攻（博士）
基础法学专攻（博士）
民刑事法学专攻（博士）
经济学研究科
学科指导范围包括理论、统计、经济学史、经济史、财政、金融、经济政策、社会政策、国际经济等各个领域。本研究科具有悠久历史传统。开设有面向一般社会人士开放的昼夜讲授制“经济学家”课程。在作为志于从事税理士、会计师及公务员等专职工作人员的专业培训方面，也作出相应成就。
经济学专攻
商学研究科
囊括经营学、会计学、市场营销、金融、商务信息、国际商务六项领域在内。设有“研究职业”与“专业知识”两门课程。前者为面向有志成为具有高度洞察力与分析能力学者的5年一贯制，后者则为面向未来致力于从事企业工作的为期两年的硕士课程。
商学专攻
社会福利研究科
硕士课程掌握对福祉各领域的调查能力、分析能力、政策制定能力，培养能为社会作出贡献的人才。博士课程致力于培养高度研究能力，从事独创性研究，以获取博士学位为目标。
社会福利专攻
理工学研究科
设有数理科学专业、物理学专业、化学专业、生命科学专业、信息科学专业。曾多次获奖，深受好评，推动研究走向新阶段。借助神户三田校区的良好研究环境与设备，内容生动活泼的教育与研究活动不断有所发展。
物理学专攻
理论物理、实践物理
化学专攻
无机分析化学、物理化学、有机化学
生命科学专攻
细胞机能、环境应答、再生科学、医化学
情报科学专攻
网络系统、信息系统、影音系统、电脑化机器人学
数理科学专攻
纯粹数理、应用数理
综合政策研究科
分设为公共政策、环境政策、语言文化政策、都市政策、国际政策和传媒信息六项领域。通过学际手段，针对现实政策课题进行研究。还通过“产官学研究协力机构”，建立起将学习研究与现实社会密切挂钩的教育指导体系。前期课程中开设用英语授课和撰写论文的英语课程(International Studies & Development)。
综合政策专攻
公共政策、环境政策、言语文化政策、都市政策、国际政策、传媒
教育学研究科
1专业(教育学)、2领域(幼儿教育学、临床教育学)。培养敢于面对现代复杂而多样的教育问题，以高度专业知识能肩负指导任务的专业教育人员和研究人员。
教育学专攻
幼儿教育、初等中等教育、临床教育
言语交际文化研究科
分7个研究领域：语言科学、语言文化学(英语)、语言文化学(法语)、语言文化学(德语)、语言文化学(东亚)、语言教育学和日语教育学。本研究科是以语言教育研究中心(宗旨为Better Communication for Better World)为母体的独立研究科。硕士阶段注重培养语言交际能力为本研究科一个特长。为了便于社会人士的学习，实行学期制和昼夜授课制。
言语交际文化专攻
语言科学、英语文化、法语文化、德语文化、东南亚语言文化、语言教育、日语教育
司法研究科
目的在于培育能以高度的专业知识与丰富的人性来解决问题的“精通企业法务法曹”、“人权意识丰富的市民法曹”和“活跃在国际舞台的法曹”。 大半专任教员为实务家教员，与学者教员密切配合热心施教。
法务专攻（职业化）
经营战略研究科
由“Business School”(经营战略专业)和“Accounting School”(专职会计专业)两个专业构成。2008年4月新增设博士课程(先进经营专业)，是培养经营·会计专业人的专职研究生院。“Business School”的企业经营战略课程和国际经营课程均可获得MBA。
经营战略专攻（职业化）
企业经营战略课程（MBA）
国际经营课程（MBA）
会计专攻（职业化）
尖端管理学专攻（博士）
