1、庆应义塾大学
（文法科系1999的综合排名第一，理工科系1999的综合排名第三)
概况：私立，1858年建校，教授和副教授770名，在校本科人数24623名，研究生2043名。
2、早稻田大学
（文法科系1999的综合排名第二)
概况：私立，1882年建校，教授和副教授932名，在校本科人数44038名，研究生3144名。
3、京都大学
（文法科系1999的综合排名第四，理工科系1999的综合排名第六)
概况：国立，1897年建校，教授和副教授1379名，在校本科人数13056名，研究生4096名。
4、关西大学
（1999的综合排名第八)
概况：私立，1886年建校，教授和副教授458名，在校本科人数名，研究生名。
5、东京大学
（文法科系1999的综合排名第十，理工科系1999的综合排名第九）
概况：国立，1877年建校，教授和副教授1697名，在校本科人数15258名，研究生5536名。
6、大阪大学
（理工科系1999的综合排名第十一）
概况：国立，1931年建校，教授和副教授989名，在校本科人数11388名，研究生3177名。
7、同志社大学
（文法科系1999的综合排名第十三）
概况：私立，1875年建校，教授和副教授377名，在校本科人数20873名，研究生606名。
8、东北大学
（理工科系1999的综合排名第十四）
概况：国立，1907年建校，教授和副教授1076名，在校本科人数5813名，研究生2563名。
9、神户大学
（文法科系1999的综合排名第十六）
概况：国立，1902年建校，教授和副教授683名，在校本科人数11414名，研究生1615名。
10、东京工业大学
（1999的综合排名第十七）
概况：国立，1881年建校，教授和副教授540名，在校本科人数4927名，研究生2415名。
11、筑波大学
（1999的综合排名第十八）
概况：国立，1973年建校，教授和副教授957名，在校本科人数8888名，研究生3054名。
12、北海道大学
（文法科系1999的综合排名第二十，理工科系1999的综合排名第十九）
概况：国立，1876年建校，教授和副教授1081名，在校本科人数5779名，研究生2628名。
2009年日本大学专业排名
综合排名
日本排名世界排名大学名论文数
119东京大学55343
230京都大学40825
337大阪大学35430
483东北大学31842
5102名古屋大学23380
6108九州大学24321
7154北海道大学21283
8179东京工业大学19155
9227筑波大学13815
10263广岛大学13057
化学排名
日本排名世界排名大学名论文数
12京都大学7867
23东京大学7364
39东京工业大学6724
411大阪大学6388
517东北大学5537
624北海道大学4001
728九州大学4376
847名古屋大学3467
986分子科学研究所1794
10108东京理科大学2184
生物学、生化学领域
[$pagetag]日本排名世界排名大学名论文数
14东京大学6128
218京都大学4328
39大阪大学4027
411九州大学2265
517名古屋大学2380
624东北大学1942
728北海道大学2175
87筑波大学1398
986神户大学1035
10108德岛大学1053
物理学领域
[$pagetag]日本排名世界排名大学名论文数
11东京大学12105
219东北大学8341
328大阪大学7216
430九州大学6462
564名古屋大学4649
678东北大学3783
779NTT2770
883筑波大学3482
9101NEC2036
10157高能加速器研究机构1098
材料科学领域
[$pagetag]日本排名世界排名大学名论文数
11东北大学3659
29京都大学2165
312大阪大学2122
413东京工业大学1898
524东京大学2252
641九州大学1184
765名古屋大学1148
867大阪府立大学718
9104物质材料研究机构995
10108北海道大学862
